Big Data för medicinsk forskning

- Framtidens medicinska forskning kommer att innehålla datorer. Vi är obönhörligt beroende av datorer och vi vill stärka datorbaserade metoder inom medicinsk forskning, säger Ola Spjuth, koordinator vid Swedish e-Science Research Center som leds från Karolinska Institutet och en av arrangörerna till konferensen. Epidemiologi är ett sådant forskningsfält där tusentals personer bidrar med miljontals eller fler datapunkter. Andra exempel är DNA- och proteinsekvensering där forskare hanterar stora mängder data för att hitta sjukdomsgener eller markörer för sjukdom eller behandlingssvar. Sådan forskning är inte möjlig utan avancerad användning av datorer. E-science är ett begrepp som får allt större betydelse och som delvis handlar om att kombinera datoriserad forskning med ett annat forskningsfält, som medicin. Utmaningarna är många, både rent tekniskt med forskning kring algoritmer, avancerade datorbaserade metoder och användning av superdatorer för simuleringar och beräkningar. Även juridiska och etiska frågor måste diskuteras när data som ofta är känslig för en enskild individ ska användas, lagras och hanteras säkert. Gilean McVean, som förestår det nyetablerade Oxford Big Data Institute, England, kommer under konferensen att tala om hur Big Data kan användas i medicinsk forskning. Om vad stora data är, vad som behövs för att analysera dem och vad som motiverar att forskningsvärlden nu satsar stort på Big Data och e-science. I Danmark ligger man långt framme inom storskaliga epidemiologiska studier och registerforskning och Mads Melbye, direktör vid Statens Serum Institut, Danmark, berättar om hur man analyserar information från mycket stora patientmaterial, i vissa fall från hela landets befolkning. Danmark arbetar dessutom mycket med att integrera data från patientregister med uppgifter från biobanker. Niklas Blomberg leder det europeiska samarbetsprojektet ELIXIR. Han ger ett europeiskt perspektiv på framtidens storskaliga forskningsinfrastruktur och vikten av att få till standarder och att dela och samköra data över länder i Europa. Konferensen arrangeras av The Swedish e-Science Research Centre, SeRC, en sammanslutning av forskare inom såväl teknik som medicin. De fyra universiteten Karolinska Institutet, Kungliga Tekniska högskolan, Stockholms universitet och Linköpings universitet står bakom denna nationella strategiska satsning. Journalister är välkomna till konferensen "Big Data and e-Science in Medical Science”, och att intervjua forskarna. Anmäl dig till sabina.bossi@ki.se Tid och plats: 23-24 april, Karolinska Institutet Campus Solna Lokal: Onsdag den 23 april i Erling Persson-salen i Aula Medica på Nobels väg 6, och torsdag den 24 april i Samuelsson-salen på Tomtebodavägen 6. Karta.

Programx

För mer information, kontakta: Ola Spjuth, PhD, koordinator för Swedish e-Science Research Center Tel 070-425 06 28, e-post: ola.spjuth@ki.se Timo Ropinski, professor i interaktiv visualisering, Linköpings universitet Tel 011-36 36 15, e-post timo.ropinski@liu.se Erik Lindahl, professor i bioinformatik, Stockholms universitet Tel 08-524 815 67, e-post erik.lindahl@dbb.su.se Sabina Bossi, pressekreterare, Karolinska Institutet Tel 08-524 860 66, e-post sabina.bossi@ki.se Peter Larsson, pressekreterare, Kungliga Tekninska högskolan Tel 08-790 69 60, e-post p3t3r@kth.se