Så kan maskininlärning förbättra processen för framtagande av läkemedel
För tre veckor sedan utmanade AI Sweden och bioläkemedelsföretaget AstraZeneca experter på maskininlärning att hitta en lösning för att slippa använda infärgning när man testar nya läkemedel på cellkulturer. Igår utsågs ett vinnande lag vars algoritm skall användas för att hjälpa AstraZeneca att accelerera utvecklingen av läkemedel.

Åtta lag, bestående av svenska och internationella representanter från både universitet och privat sektor, har deltagit i ”Adipocyte Cell Imaging Challenge”. Lagen har tagit sig an uppgiften att med hjälp av maskininlärning effektivisera framtagandet av läkemedel. Det vinnande laget, HASTE team, består av forskare från Uppsala Universitet och valdes ut av en jury bestående av representanter från AstraZeneca, Vinnova och AI Sweden.
- Vi på AstraZeneca ser att vi kommer att kunna ha nytta av resultaten omgående. Vårt partnerskap med AI Sweden och lagens bidrag har öppnat upp för både nya idéer och nya samarbeten. Det kommer att ge oss en språngbräda för att öka vår kapacitet och potentiellt snabbare få ut nya läkemedel på marknaden.
Anders Holmén, Vice President and Head of Pharmaceutical Sciences BioPharmaceuticals R&D, AstraZeneca
Ett verktyg som används för att utveckla system för målstyrda läkemedel är högupplöst mikroskopi. Förändringar av cellstrukturen analyseras för att bedöma effekten av olika typer av läkemedel. För att mikroskopet ska kunna differentiera mellan olika cellstrukturer krävs det att man i ett första steg förbereder cellerna genom att färga dem. Detta är både tidskrävande och kostsamt. Dessutom kan infärgningen påverka cellerna på ett artificiellt sätt vilket inkräktar på slutresultatet och försvårar insamlingen av tillförlitlig data över tid, till exempel när man ska studera effekten av läkemedelsintag under en längre period.
Det är här maskininlärning kommer in i bilden. Det vinnande laget HASTE team har nämligen hittat en lösning så att man med hjälp av maskininlärning kan läsa av även de gråskaliga bilderna av celler som inte är färgade med toxisk färg. De använde sig av en teknik som dels fokuserar på att samla in datapunkter för att skapa en överblick av cellstrukturen, dels söker specifikt efter information om cellens kärna, så kallad privilegierad information. Tack vare detta är det möjligt att hoppa över infärgningen av celler och direkt få en förståelse för hur cellen är uppbyggd och reagerar på nya läkemedel.
En avgörande faktor i arbetet har varit tillgången till AI Swedens datafabrik, vilken innefattar en av Nordens kraftigaste datorer. Datan kommer att tillgängliggöras här för relevanta aktörer inom kort.
Laguppställning HASTE Team
Philip J Harrison, Uppsala Universitet
Håkan Wieslander, Uppsala Universitet
Ankit Gupta, Uppsala Universitet
Ebba Bergman, Uppsala Universitet
Erik Hallström, Uppsala Universitet
Nyckelord
Kontakter
Karin Vajta EngströmCommunications strategist
Tel:+46(0)730580994karin.vajta@ai.seBilder
Om
AI Sweden är Sveriges nationella center för artificiell intelligens. AI Sweden stöds av
svenska staten samt näringsliv och offentlig sektor över hela Sverige. Målet är
att accelerera användningen av AI för att stärka Sveriges välfärd och konkurrenskraft, och
förbättra livet för alla som lever i Sverige.
För att lyckas med detta driver centret AI-projekt av nationellt intresse inom områden som
informationsdriven hälsa, svenska språkmodeller och datadriven mobilitet. AI Sweden
tillhandahåller också riktade kompetensutvecklingsinsatser till partners och allmänhet.
Följ AI Sweden
Abonnera på våra pressmeddelanden. Endast mejladress behövs och den används bara här. Du kan avanmäla dig när som helst.
Senaste pressmeddelandena från AI Sweden
AI Sweden gathering forces to lead the development of edge learning27.4.2022 14:00:00 CEST | Press release
In 2021 AI Sweden launched the Edge Learning Lab together with industrial partners such as Volvo Cars, Zenseact, and HPE. A year later, the lab has gained significant international attention and is now forming a consortium with participation from international academic and industrial heavyweights to accelerate the technological development and application of edge learning globally.
AI Sweden lanserar digital plattform för gränsöverskridande AI-samarbete26.4.2022 08:14:25 CEST | Pressmeddelande
AI Sweden lanserar My AI, en plattform specifikt designad för alla som är verksamma inom eller nyfikna på AI.
Europeiska rymdorganisationen och AI Sweden öppnar rymdlabb i Göteborg17.3.2022 10:00:00 CET | Pressmeddelande
AI Sweden och Europeiska Rymdorganisationen, ESA, ska öppna ett labb för avancerad teknikutveckling för AI i nya rymdapplikationer och användningsområden för jordobservation. Φ-lab@Sweden, som labbet heter, är först ut som ett spjutspetslabb inom ett stort europeiskt samarbete om rymdinnovation och kommer invigas under våren.
Sverige knyter upp sig mot en av världens främsta AI-hubbar9.2.2022 07:00:00 CET | Pressmeddelande
En av de hetaste platserna i världen för AI-forskning och utveckling är Montreal i Kanada, med forskningsinstitutet Mila i spetsen. Sveriges nationella AI-center, AI Sweden, blir nu partner till Mila och etablerar en nod för samverkan i Montreal.
Nationellt toppmöte om AI och demokrati i Göteborg 20-21 oktober14.10.2021 07:45:00 CEST | Pressmeddelande
Future of Democracy Summit är ett nytt, nationellt initiativ som fokuserar på frågan hur digitaliseringen och AI kan nyttjas på ett demokratiskt hållbart sätt. Den 20-21 oktober samlas beslutsfattare och experter från olika discipliner i samhället på Lindholmen Science Park i Göteborg, för att diskutera hur utveckling och konkurrenskraft kan säkras, samtidigt som medborgarnas integritet och delaktighet värnas.
I vårt pressrum kan du läsa de senaste pressmeddelandena, få tillgång till pressmaterial och hitta kontaktinformation.
Besök vårt pressrum